平成５（１９９３）年、冨田太学校長の退職に伴い寺部曉が第６代の学校長に就任した。新学校長のもとで本校は「セルフコントロール＆コミュニケーション」ができる生徒の養成をめざすことになった。この教育目標達成のため、より高い視野でより高い位置をめざした教育活動が展開された。本校の教育活動の３つの柱である「学習指導」「生徒指導」「自主活動」において、質的な転換が図られることになった。
そのなかでも、９年度からの学校５日制の導入と、学習目標に基づく学習指導システムの採用、１１年度からの男女共学化は本校４０年の歴史のなかでもっとも大きな改革であった。
特に学校５日制導入に関しては、本校が進学校であることから、生徒の学力低下を招かないように学校全体として入念な準備が必要であった。授業時間数の減少をカバーするため、土曜日には本校独自の教育活動を実施することにした。また、新学習指導システムを採用し、学力評価を従来の相対評価から学習目標に対する絶対評価に変更した。進学校として更なる発展を遂げるべく、１４年から、課外講座、小論文ゼミ、資格試験対策講座などの新しい試みがスタートした。
安城学園の将来構想を総合的に検討する政策室は、９年１０月１４日、本校での中間報告会で、男女共学問題を提起した。１０月下旬以降、運営委員会において、現行の問題点と見通し、共学化の是非の検討が進められるともに、１１月初旬からは教科会ごとでの検討も進められた。１２月９日、職員会議で経過報告がなされ、「学習指導」「生徒指導」「自主活動」の３本柱と施設設備を中心に討議する一斉教科会が開催された。
こうした検討から、共学化してプラスになるのか、共学化に教職員が対応できるのか。男子校しかできないことを今まで以上にやっていくことで将来展望は無いのか、という共学化を危倶する意見もあった。しかし、進学・クラブの実績を上げつつ、地域での評価・信頼度も定着させて、先進的に完全学校週５日制をはじめとした教育改革を推進している本校が、更にいっそうの発展をめざし、理想の学校へと近づくためには、男女共学化が更なる勢いとなる、というのが全体的な討議の流れであった。
９年１２月１９日の職員会議で学校長は、１．カリキュラム・コース制の問題、２．生徒指導、３．自主活動、４．施設設備、５．生徒募集の５つの検討委員会を設置、この委員会での共学化に伴う諸問題の集中審議を指示した。各委員会は、それぞれの分野において、教職員の調査・研究などの努力が不可欠であるという前提のもとで、教育改革の延長として共学移行をとらえ、改善点・再検討を要する点を指摘しながらも、共学化が、生徒募集・自主活動をはじめとして本校のいっそうの活性化につながると報告した。
男子校とは異なる諸問題が予想される生徒指導においても、「見逃さない」「見落とさない」「見放さない」という、従来からの大原則に沿って対応すれば、大きな混乱はないとまとめられた。約２カ月の集中審議を受け、１０年２月の運営委員会討議を経て、２月１６日、臨時職員会議が開かれ、学校長から１１年度より共学移行の決定が示された。
１３年度をもって女子学生は全体の２３％を占め、共学化が完成した。共学校としてのスタートは順調であった。